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중도퇴사자 종합소득세 신고, 인사담당자가 반드시 알아야 할 3가지

2025-04-30

5월 종합소득세 신고는 퇴사자가 직접 하지만, 그 과정에서 필요한 정보 제공은 인사담당자의 의무입니다.

이번 글에서는 퇴사자・중도퇴사자 종합소득세 신고 방법과 미신고 시 불이익, 인사담당자가 꼭 알아야 할 3가지 주의점에 대해 알아보겠습니다.

1. 퇴사자・중도퇴사자 종합소득세 신고 방법

퇴사자・중도퇴사자는 재취업, 프리랜서 전환, 창업 여부에 따라 종합소득세 신고 방식이 달라집니다.

▪︎ 재취업한 경우

퇴사 후 재취업했어도 새 직장에서 12월 말까지 근무 중이었다면, 전 직장의 소득과 합산해 새 회사가 연말정산을 대행해 줄 수 있습니다.

하지만 연말정산 시점에 재직 중이 아니라면, 본인이 5월 종합소득세 신고를 직접 해야 합니다.

이때 전 직장 영수증을 새 직장에 제출하는 것이 아닌, 본인이 국세청에 신고하는 것임에 주의해야 합니다.

▪︎ 재취업하지 않은 경우

회사는 퇴사자의 마지막 월급을 정산할 때 기본공제만 적용해 중도정산을 진행합니다.

그래서 퇴사 시기가 언제든, 의료비·교육비·신용카드 사용액 같은 공제를 더 받으려면 퇴사자가 다음 해 5월에 직접 종합소득세 신고를 해야 합니다.

종합소득세 신고 시기와 방법, 필요 서류 확인하기 >

▪︎ 퇴사 후 창업 또는 프리랜서 활동한 경우

퇴사 후 창업했거나 프리랜서로 활동해 수입이 생겼다면, 퇴사 시기와 상관없이 다음 해 5월에 종합소득세를 꼭 신고해야 합니다.

종합소득세는 한 해 동안 벌어들인 모든 소득을 합쳐 세금을 정산하는 제도입니다. 따라서 근로소득 외에 소득이 있다면 모두 합산해 신고해야 합니다.

이때는 전 회사에서 받은 근로소득 원천징수영수증도 함께 제출해야 하며, 사업자 등록이 없어도 원고료·강의료 등 기타소득이 연 300만 원을 넘으면 신고 대상이 됩니다.

2. 퇴사자・중도퇴사자가 종합소득세 신고를 안 하면 생기는 불이익 3가지

1) 가산세 부과

퇴사자・중도퇴사자가 종합소득세를 신고하지 않으면 가산세가 부과될 수 있습니다.

  • 무신고 가산세: 납부할 세액의 20% 부과
  • 부정무신고* 가산세: 납부할 세액의 40% 부과
  • 납부지연가산세: 미납 기간에 따라 미납세액의 일정 비율이 가산세로 부과

*세금 신고를 고의로 하지 않거나, 거짓으로 신고한 경우

2) 세액공제 및 감면 혜택 상실

의료비, 교육비, 신용카드 사용액 등 다양한 항목에 대한 세액공제 및 감면 혜택을 받을 수 없습니다.

이로 인해 불필요한 세금을 추가로 납부하게 될 수 있습니다.

3) 과태료 등 법적 조치

고의적으로 종합소득세를 신고하지 않거나 허위로 신고하는 경우, 과태료 부과 또는 형사처벌 대상이 될 수 있습니다.

3. 인사담당자가 꼭 확인해야 할 체크리스트 3가지

퇴사자·중도퇴사자의 종합소득세 신고는 본인이 직접 해야 하지만, 인사담당자가 미리 확인하고 준비해야 할 사항들이 있습니다.

1) 근로소득 원천징수영수증 발급

근로자가 퇴사한 경우, 사용자는 퇴사일까지의 급여를 정산하여 근로소득 원천징수영수증을 발급해야 합니다.

영수증에는 퇴사 시점까지의 소득과 세금 내역이 정확히 기재되어야 합니다.

  • 발급 기한: 퇴직소득을 지급한 달의 다음 달 말일까지
  • 발급 방법: 요청 시 이메일·팩스 등으로 신속하게 제공

2) 퇴사 시 중도정산 실시

퇴사 시에는 기본공제와 표준세액공제만 적용해 급여를 정산합니다.

신용카드, 의료비, 교육비 등은 근무 기간 중 사용한 금액만 공제되기 때문에 이 점을 정확히 안내해야 합니다.

재직 기간에만 공제받는 항목 확인하기 >

3) 종합소득세 신고 안내

퇴사자에게 5월 종합소득세 신고 대상 여부와 필요 서류(원천징수영수증 등), 신고 방법 등을 명확히 안내해야 합니다.

특히 12월 퇴사자의 경우, 연말정산 없이 퇴사 처리만 하는 경우가 많습니다. 이럴 땐 직원이 종합소득세를 직접 신고해야 하므로, 퇴사 시점에 꼭 안내해야 합니다.

5월 종합소득세 신고는 퇴사자가 직접 해야 하며, 회사의 역할은 정확한 원천징수영수증 발급과 신고 안내에 있습니다.

이번 글을 통해 공제 누락, 영수증 미발급, 안내 부족 등 종합소득세 신고 관련 놓치기 쉬운 부분을 점검해보시기 바랍니다.

간편해지는 직원 관리 알아보기 >
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